本发明公开了一种大气污染物排放通量处理方法、存储介质以及计算机终端。其中，该方法包括：获取大气污染物浓度的观测值和大气污染物浓度的初始排放通量，其中，观测值用于表征目标站点对采集到的大气污染物浓度的浓度进行测量得到的数值；利用大气传输模型对观测值和初始排放通量进行处理，得到大气污染物浓度的目标导数，其中，大气传输模型通过深度学习框架构建，大气传输模型用于表征大气污染物浓度在大气中的动力学传输过程，目标导数用于表征观测值相对于排放通量的导数；基于目标导数对初始排放通量进行更新，得到大气污染物浓度的目标排放通量。本发明解决了相关技术中对大气污染物浓度的监测准确度较低的技术问题。