本发明涉及细菌分离技术领域，具体涉及一种细菌多级分离筛选设备，包括壳体，所述壳体内侧面顶部设置有三个滤框，所述壳体内底面固定连接有固定盒，所述固定盒内侧面转动连接有驱动杆一，所述驱动杆一内侧面转动连接有驱动杆二，且驱动杆二内侧面转动连接有与固定盒内底面转动连接的驱动杆三。本发明中，通过套杆侧面滑动连接有两个传动轮，动力机构可以带动连接杆与驱动杆一转动，连接杆可以通过传动机构带动驱动杆二与驱动杆三转动，可以调节同一套杆上两个传动轮的间距，这样在连接杆转动速度不变时，可以改变驱动杆二与驱动杆三的转速，从而根据需要调整多级筛选的离心速度比。