本发明属于新能源电动车技术领域，具体公开了一种新能源电动车蓄电池复合电源的能量管理方法及系统，其中方法包括以下步骤：对新能源电动车车用新能源电动车蓄电池复合电源系统的整体结构进行研究，将其分成多个子模块进行设计；根据电动车的实际情况选择和优化超级电容参数，搭建新能源电动车蓄电池复合电源系统结构，并进行控制系统的软硬件设计；建立复合电源系统的数学模型，设计复合电源系统的能量管理方法，并进行优化，确定最终的复合电源系统的能量管理方法。该方案提高了复合电源的能量利用率。既可对蓄电池起到保护作用，又能提高电动车的续驶里程，为复合电源新能源电动车走向市场做好前期准备工作。