本发明提供了一种基于序列变换的柴油机状态监测方法及系统，包括：获取待预测时刻；基于待预测时刻，采用最优柴油机状态监测模型，得到待预测时刻的柴油机运行参数；所述最优柴油机状态监测模型的获取步骤为：采集柴油机不同历史时刻的运行参数，构建原始序列；选取预处理方法，基于变换参数对原始序列进行变换，并以柴油机状态监测模型的综合评估指数最小化为目标，不断优化变换参数，得到最优柴油机状态监测模型。不仅定义了综合评估指数，保障了模型精度的最优，而且消除了传统评价指标体系中存在的“误判”问题。