本发明公开了基于双闭环的水肥一体化精准控制方法及系统，该系统包括注肥环、灌水环及混合执行器，注肥环包括注肥量控制器及与注肥量控制器相连的水肥溶液检测计，水肥溶液检测计用于从水肥溶液中获取对注肥量的反馈，注肥量控制器用于控制多通道施肥机输出稳定的注肥量；灌水环包括灌水量控制器及水流量传感器，灌水量控制器与水流量传感器相连，水流量传感器用于从水肥溶液中获取对注水量的反馈，灌水量控制器用于控制增压泵以输出稳定的灌水量，消除灌水量偏差；混合执行器与注肥环及灌水环相连，注肥环的水肥原液与灌水环的过滤水在混合执行器混合后，形成具有固定浓度的水肥溶液。本发明能够精确快速的控制水肥比，节约水肥比例调节时间。