本发明公开了一种流域洪水类型辨识及其影响因子解析的方法，包括以下步骤：步骤一、收集研究区内气象地理因子、人类活动因子、社会经济指标及水文站点的径流数据；步骤二、对数据进行前处理；步骤三、构建耦合超定量阈值抽样和流量序列移动方差的洪水事件划分方法，从水文站点日径流数据中划分洪水事件；步骤四、构建洪水行为特征指标体系刻画完整洪水过程；步骤五、利用聚类方法对划分所得洪水事件进行聚类，辨识流域洪水主要类型及其洪水特征；步骤六、统计分析各水文站点主要洪水类型，识别流域洪水过程区域特征；步骤七、基于地理探测器分析影响因子的空间异质性对流域洪水过程的影响。本发明方法可从长序列径流数据中准确划分洪水事件，并辨识流域主要洪水类型及其主要影响因子，可为流域洪水过程特征信息挖掘、雨洪资源利用及水资源科学管理提供支撑。