本发明提供了一种异孔共价有机骨架整体材料及其制备方法和应用，所述制备方法为首先制备多孔的聚硅氧烷海绵，通过原位生长使异孔共价有机骨架与海绵复合制备整体材料，最后在整体材料外层包裹聚多巴胺提高材料的稳定性，并调整表面性质和表面相互作用力，从而提高整体材料在实际应用中的性能。本发明所述的异孔共价有机骨架整体材料用于动物源性食品样品的非靶向筛查，通过调节材料疏水作用与氢键作用强度可以高效快速除去基质中的油脂等干扰物，同时保留化学危害因子，继而结合液相色谱‑质谱联用技术可以实现对抗生素残留的准确定性、定量分析。