本发明涉及一种明挖隧道上跨既有地铁交叉段防护体系的施工方法，包括步骤：固化一区施工；固化二区和固化七区施工；外侧围护桩和内侧围护桩施工；固化三区和固化四区施工；抗拔桩和立柱桩施工；右侧固化六区、左侧固化八区和左侧固化九区施工。本发明的有益效果是：本发明针对明挖隧道上跨既有地铁交叉段的地基加固，采用分区分块的固化体精细化作业，每一区块的标高、加固参数由核心或非核心区位、既有地铁位置、开挖工程量和固化工程量综合确定，既满足了明挖隧道基坑防护要求，又能够满足既有地铁的防护；本发明通过分区分块的精细化加固方式，在明挖隧道与既有地铁交叉段防护成本方面具有显著优势。