本发明涉及一种明挖隧道上跨既有地铁交叉段抗浮体系的施工方法，包括步骤：地基加固与防护；开挖一号分坑；开挖二号分坑和三号分坑；施工建造第一抗浮板，安装第一支架，开挖中部预留土，并安装下扁壳体和上扁壳体；扁壳体所处区域为非固化区；安装泄水管；施作后灌注体。本发明的有益效果是：通过基坑分坑间隔开挖、预留土体的方式，尽可能地减少了土体开挖后基坑底部的暴露时间，减轻原土体开挖卸载后基坑的上浮。通过在基坑底部设置支架承载水袋压重的方式，该压重承载减少既有地铁上浮，安装与拆卸更为方便，提高了压重施工效率；且支架可分3种类型分别安装，与施工工序相配合。