本发明公开了一种荧光报告基因元件、基因编辑监测系统及用途。所述基因元件包括依次连接的第一编码区、第二编码区和第三编码区；所述第一编码区包括第一荧光蛋白报告基因，所述第二编码区包括第二荧光蛋白报告基因，所述第三编码区包括第三荧光蛋白报告基因；所述第一荧光蛋白报告基因、第二荧光蛋白报告基因和第三荧光蛋白报告基因分别位于不同的阅读框中，以使仅一种荧光蛋白能正确表达。本发明的基因元件通过对目标DNA编辑结果进行实时监控，能确定最佳的编辑时间窗；通过对不同荧光发光细胞数量统计完成对目标DNA编辑结果的预测。此外，还能通过建立人源化细胞模型，进行疾病的基因治疗新技术的评估。