本发明提出一种基于序列重建的异常事件自动检测方法和系统。所述方法包括：步骤S1、利用预定义的事件模板，从多源日志中确定离散事件序列，所述离散事件序列由同一用户的多个事件日志按照时间顺序拼接而成；步骤S2、对所述离散事件序列进行拆分处理来获取若干原始子序列，并通过对所述若干原始子序列进行特征嵌入，进一步获取无监督检测模型的输入子序列，所述无监督检测模型包括LSTM编码器、变分组件和LSTM解码器，用于基于所述输入子序列生成所述离散事件序列的重建子序列；步骤S3、基于所述原始子序列和所述离散事件序列的重建子序列，利用评判准则来判断所述多个事件的异常属性。