本发明提供一种水性防水涂料废水处理工艺，包括板框压滤、陶瓷膜过滤、粉料干燥、RO反渗透浓缩、过胶体磨以及喷雾干燥步骤；所述板框压滤：将水性防水涂料废水导入板框压滤机进行过滤处理，得到浓缩液A和废水A；所述陶瓷膜过滤：将经过板框压滤工序的废水A导入陶瓷膜装置进行微滤，微滤后得到浓缩液B和废水B；所述RO反渗透浓缩：将陶瓷膜过滤后得到的废水B导入到RO反渗透浓缩系统中进行两级反渗透浓缩，得到纯净的去离子水和乳液。乳液经过胶体磨和喷雾干燥后添加抗结块剂后得到可再分散乳胶粉。浓缩液A和浓缩液B经干燥制得填料粉料。本发明工艺无废物产生，零排放，同时可得到高品质的填料粉料和可再分散乳胶粉。