本发明涉及生物技术领域，具体涉及连续提取蛹虫草胞内多糖的方法，包括如下步骤：将蛹虫草于双螺旋连续提取机中挤压得到提取液，所得提取液经微滤得到微滤透过液，所得微滤透过液经第一纳滤得到含虫草素多糖的纳滤浓缩液和含虫草素的纳滤透过液。与现有技术相比，本发明可直接从新鲜子实体中进行提取，节约了烘干能耗和提取能耗，缩短了提取流程，且本发明不添加任何化学物质实现蛹虫草胞内多糖与细胞壁、粗纤维有效分离，提取液通过微滤除杂，纳滤浓缩喷干后获得蛹虫草多糖粉，对纳滤浓缩液进行低温结晶获得虫草素，固体残渣进行烘干粉碎后，获得子实体/菌丝体粉。