本发明公开了一种鸭蛋孵化环境调控系统及方法，系统包括孵化箱以及设置在孵化箱中的温控模块、湿控模块、空气调节模块、消杀模块、孵化预警模块和信息控制组件；信息控制组件分别与温控模块、湿控模块、空气调节模块、消杀模块和孵化预警模块连接；本发明可对孵化环境进行消杀，保障了种鸭蛋的安全孵化，通过喷头可以快速提高空气中的湿度，加湿效率和效果更好，设置各个模块进行孵化箱内部环境调节，如果发生意外使得环境指标数据发生异常，则启动蜂鸣报警器提醒工人查看异常，提高了种鸭蛋孵化的安全性。