本发明公开了一种小麦穗行精准开沟装置及其使用方法，包括支架，支架连接有种子仓和肥料仓，支架连接有开沟器，开沟器连接有肥料管，肥料管和肥料仓相连通；开沟器滑动连接有左齿条和右齿条，左齿条和右齿条分别连接有独立的分流板，两个分流板之间设置有土壤通道；开沟器转动连接有调节杆，调节杆固定套设有齿轮，左齿条和右齿条均与齿轮相啮合；分流板左侧设置有与支架相连的种子管，种子管与种子仓相连通，种子管和分流板之间设置有抚平板，抚平板连接有驱动机构，驱动机构用于驱动抚平板转动。本发明可根据实际需要，选择覆土的土壤量，以此达到改变肥料覆土厚度的目的，以利于不同条件下试验工作的进行。