本发明属于现场总线技术领域，具体提供一种可灵活配置的总线式通信系统、通信方法，所述方法包括如下步骤：上位机接收用户输入的配置信息，并将接收到的配置信息下发给主机；主机接收到上位机下发的配置信息后，进行总线架构的重组；总线架构重组后，主机根据在位状态对总线上的从机进行轮询访问；主机选择通信通道发出配置或者查询命令帧后，接收从机的响应，并将从机响应数据中的状态信息发送到上位机。可以根据不同的现场需求进行外设的自我搭配，可以避免一些无效的动作，可以极大地提高总线通信的效率；同时该方案可适应于多种现场总线，通用性比较高。