本发明公开了一种柔性互联装置配置方法、装置、电子设备及存储介质，该方法包括：基于预设场景计算第一最小系统网损；根据第一最小系统网损，计算第一综合费用；根据第一综合费用最低时对应的安装容量迭代计算最小系统网损和综合费用，直至满足收敛条件，得到相应的柔性互联装置配置方案。本发明公开的柔性互联装置配置方法，通过计算系统网损，进而计算综合费用，能够根据经济指标得到柔性互联装置的安装容量和安装位置。通过多次计算系统网损和综合费用，能够获得综合费用最低时对应的柔性互联装置的最优安装容量和最优安装位置，实现了多区域配电网的互联互济，有效减小系统的运行网损费用，克服了现有技术中配置方案泛用性差且精度差的缺陷。