本发明提供了一种内科穿刺定位控制系统，该系统包括检测手术台、磁共振成像装置、穿刺针、穿刺固定装置、输入装置、计算机装置、输出装置和与所述输出装置连接显示穿刺部位可透视化信息的头戴式显示设备。本发明将底罩固定在最佳穿刺点上，避免穿刺抽取过程中的偏位，同时将三维穿刺图像投射到头戴式显示设备上，并将头戴式显示设备与所述磁共振成像装置联合，进行穿刺动作，可透视化穿刺深度，提高穿刺成功率，本发明有效提高本领域中的内科穿刺定位的可透视性和准确性。