本发明涉及信息技术领域，具体涉及一种基于区块链的实验室论文存证系统，包括若干个上位机模块、存证模块和关联模块，采集单元收集试验设备数据和关联录入数据，存证单元提取试验数据的哈希值，存储单元将试验数据关联存证哈希值和区块高度存储，共享单元将试验数据使用对称加密算法加密后，关联数据ID上传到区块链，将限时加密后的Key关联数据ID、试验设备和试验项目发送给关联模块，列举实验室论文涉及的试验数据的目录信息纳入目录集提交关联模块，关联模块读取与目录集包含的试验设备及试验项目相符的限时加密的Key，若成功解密Key，则将试验数据与实验室论文关联。本发明的实质性效果是：提高了实验室科研论文的数据可信度。