本发明公开了一种含肽海藻活性物质及萃取海藻活性物质的方法，属于微生物技术领域，所述含肽海藻活性物质包括以下按照重量份的原料：海藻原料10‑25份、活性肽提取液8‑12份、海藻裂解菌株2‑5份、乙酸乙酯1‑3份；减少了对海藻活性物质的破坏，保留更多海藻活性物质，提升海藻作为有机水溶肥的肥效，使海藻肥的质量更稳定。使用了海藻活性物质进行萃取，可以制成含肽海藻活性物质提取物的掺混肥料，在施用肥料以后就既能达到配方施肥、合理用肥的目的，又能起到改善土壤结构，促进作物生长发育的作用。