本发明提供了基于深度学习的防疫信息处理方法及防疫服务系统，通过响应于噪声处理请求，收集目标防疫流调任务的待处理人员流调统计日志；在待处理人员流调统计日志中具有疑似混淆流调信息的基础上，确定疑似混淆流调信息所指向的局部流调统计内容集；对疑似混淆流调信息所指向的局部流调统计内容集执行多个流调统计噪声种类的流调统计噪声分析，获得疑似混淆流调信息的流调统计噪声分析清单。这样在流调统计噪声分析时，可以分析出疑似混淆流调信息相对于多个流调统计噪声种类的分析结果，从而减少疑似混淆流调信息的个别流调统计噪声的分析遗漏的可能性，继而便于提升疑似混淆流调信息的流调统计噪声分析的精度和可信度。