本发明公开了一种基于大数据的碳交易市场智能分析方法及系统，涉及数据处理技术领域。获取当前的多种影响因素数据和预设历史时间段内的碳配额交易价格，对碳配额交易价格进行EMD分解，得到原始数据分量；对原始数据分量进行特征选择，得到第一输入数据；第一输入数据包括自相关数据和互相关数据；对多种影响因素数据进行特征选择，得到第二输入数据；根据第一输入数据和第二输入数据，计算预测碳配额交易价格；进行碳交易市场的碳配额分配。该方法将互相关数据和多种影响因素数据结合进行预测，可以通过多尺度多因素对碳配额交易价格进行预测，提高碳配额价格预测的精准度，进而提高碳交易市场碳配额分配的效率。