本发明属于卫星通信系统的传输方法，为解决目前低轨卫星通信系统采用Ka频段进行信号传输易受天气影响的技术问题，提供一种基于低轨卫星通信系统的自适应传输方法，根据卫星仰角变化范围，以及卫星仰角概率密度函数，推导得到基于卫星仰角变化的雨衰概率密度函数，再根据当前信道状态和雨衰概率密度函数计算得到信道参数值，从而确定信道状态信息，再计算得到当目标误码率为系统目标误码率时，不同信道状态和调制编码方式下的信噪比阈值，再利用自适应调制编码选择算法，将反馈信噪比与计算得到的信噪比阈值进行对比，选出最佳调制编码方式，通过该最佳调制编码方式对信号进行调制编码之后，再进行下一次信号传输。