本发明提供了一种氢气吸附器再生系统及其方法，其中再生系统包括：第一供气单元，用于提供待处理氢气；吸附单元，与第一供气单元连接，包括至少两个可切换使用的第一吸附器和第二吸附器，在第一吸附器进行吸附时，第二吸附器进行再生；再生气供给单元，与吸附单元连接，用于向第二吸附器提供再生气，以利用再生气将第二吸附器再生时产生的杂质气体排出；高纯氢气供给单元，与吸附单元连接，用于向第二吸附器提供预设温度范围的高纯氢气，以利用高纯氢气将第二吸附器中的再生气排出；泄放单元，与吸附单元连接，用于至少将第二吸附器中的杂质气体和再生气进行泄放。本申请提供的氢气吸附器再生系统能够提高氢气吸附器的再生深度。