本发明实施例公开了一种医疗内窥镜影像系统及控制方法，该系统包括视频采集装置、显示器和图像处理单元，图像处理单元用于：连接外部的医学数据库，并获取外部的医学影像数据；对医学影像数据进行图像处理，以得到对应的特征区域集合；获取第一采集图像；第一采集图像通过视频采集装置采集；将所述第一采集图像与得到的所述特征区域集合进行匹配，以判断出所述特征区域集合中的各特征区域是否均被采集；若否，则生成提示信息并在所述显示器中显示，同时触发所述视频采集装置继续进行图像采集，以避免检查出现遗漏。本发明能够提高在内窥镜检查过程中的全面性与针对性，解决现有技术中容易出现检查遗漏的缺陷。