本发明涉及加氢站氢气监控技术领域，具体为一种加氢站氢气泄漏的监控系统及监控方法。一种加氢站氢气泄漏的监控系统，包括管道组件，包括设于卸气模块内部的第一管道体，设于增压模块内部的第二管道体，设于加注模块内部的第三管道体，连接所述第一管道体和所述第二管道体的第四管道体，以及连接所述第二管道体和第三管道体的第五管道体。本发明能够在加氢过程中，通过第一质量流量计、第二质量流量计以及质量流量差计算单元对整个氢气管道进行全面漏氢检测以初步判定氢气管道是否具有漏氢迹象；能够在停运过程中，通过第一质量流量计、第二质量流量计、第一氢气异常波动检测单元以及第二氢气异常波动检测单元快速找到具体的氢气泄漏位置。