本发明提供了基于环境监测的数据处理方法、设备及存储介质，可以利用环境质检知识关系网，从待进行监测的生态环境系统中确定存在环境危害趋势事件的初筛环境监测数据集，保障了初筛环境监测数据集的确定思路是基于环境危害趋势事件的联动影响范围和危害属性实现的，可以提高初筛环境监测数据集的精度和可信度，这样能够基于每个初筛环境监测数据集对环境危害趋势事件进行准确有效的跟踪分析，以此可以保障获得的跟踪分析报告的精度和完整性，还可以利用类似的跟踪分析思路而非机械式的处理思路来实现对这些环境危害趋势事件的跟踪分析，提升了环境危害趋势事件的跟踪分析的智能化程度和灵活性，也可以保障环境危害趋势事件的跟踪分析的效率。