本实用新型公开了一种混合式船舶脱硫系统的余热发电系统，它包括脱硫塔，脱硫塔包括相互连通的进烟喉道和主塔体，进烟喉道内设有预降温喷淋装置，进烟喉道的下端出口连通有蒸发器，蒸发器位于循环发电系统内，蒸发器连通有预热器，预热器的一端连通预降温喷淋装置，预热器的另一端连通有一号管路；主塔体内设有脱硫喷淋装置，脱硫喷淋装置上连通有二号管路，一号管路和二号管路共同通过三号管路向外连通有提供的冷源的海水泵；主塔体的下端出口通过四号管路连通有水循环处理系统，水处理系统通过五号管路连通三号管路。本专利实现船舶同时装配余热发电系统及混合式脱硫系统，有效节约燃油成本，提高能量利用效率，并且同时满足低硫排放的要求。