本实用新型涉及干细胞冷冻保存技术领域，具体为一种干细胞冷冻保存设备，包括保存箱，所述保存箱内壁的上侧固定连接有放置架，通过冷却剂盒定向位移联动控制涡轮对盒内冷空气进行迅速导出，可有效提高冷却剂盒对保存箱内的制冷效果及效率，且通过主动引导保存箱内空气流动，可进一步加快保存箱内冷空气的分散，保证了箱内不同位置均能实现同步低温，避免温度传导差异导致干细胞受损，涡轮于主气口内旋转时磕碰主气口内的挡柱，以此造成冷却剂盒的高频振动，可有效加快冷却剂盒表面凝结的冷凝水的流动，并快速震落至保存箱底部通过排水口排出，无需整体开启保存箱的情况下即可实现冷凝水的清理，避免箱内湿度过高影响干细胞的保存。