本申请提供了一种多区域自动化灌溉系统，包括蓄水模块、蓄肥模块、比例泵、排液管和多个传感器；其中，蓄水模块具有搭载单向阀的排水管，蓄肥模块具有搭载常压阀的排肥管。比例泵具有进水端、进肥端和排液端；排液管具有进液管和多个排液口，每个排液口均具有控制阀。多个传感器设置在多个种植区内。使用时，开启单向阀和常压阀，使灌溉水和肥料进入比例泵内混合；随后，混合液通过排液端进入排液管内，开启任一控制阀，即可对相应的种植区进行灌溉作业，直至此区域对应的传感器检测到的含水量满足灌溉要求。本申请提供的多区域自动化灌溉系统，减少人力成本，实现自动化灌溉，保证灌溉效果的同时，避免种植区对畜牧区的正常运行造成影响。