本发明公开了一种定量高精度毛细管电泳仪。该电泳仪由泵、混合器、定量进样阀、导电池、检测器、高压电源、分离毛细管、电极、缓冲液瓶、废液瓶及阀门和连接管路经连接组成。其中，采用二元溶剂系统进行输送操作，拓展了毛细管电泳的应用领域；采用定量阀与高压电场隔离，提高了系统稳定性；采用压力流与电渗流同时作为溶液的驱动力，可方便调节样品流出时间与顺序，改善分离效果。本发明的电泳仪具有分离效率高、分离速度快、样品及溶剂用量少、原料成本低、污染少等特点，可用于医药、环保、生物工程等领域中基因、蛋白质及其他化合物的分离与分析。