本实用新型公开了一种机电一体式上样装置，其中，该机电一体式上样装置包括安装底板以及设置于安装底板上的电气控制板、样本台和三维移动组件，样本台用于盛放样本和反应液体，样本台设置在三维移动组件上，三维移动组件可实现样本台在三维方向上的移动，电气控制板与三维移动组件电气连接，以控制三维移动组件的移动。本实用新型还公开了一种毛细管电泳仪。本实用新型通过将上样装置的电气控制板与上样装置的机械部分装配成一体，使得上样装置能够在整机外进行独立的生产、调试和技术检验，这样上样模块在整机上经过简单的调试即可达到技术要求，进而能够有效提高毛细管电泳仪的生产效率。