本发明针对移动虹膜识别系统及其采用这种系统的虹膜识别方法进行了改进。本发明的移动虹膜识别系统包括如下部分：用于在指引使用者进入一定距离范围内并对准使用者的眼睛之后，获取使用者虹膜信息的指示模块；用于储存上述指示模块所获取的虹膜信息的存储器；从储存在上述存储器内的信息中提取虹膜的位置信息，并将其处理为虹膜编码的信息处理器；用于传送上述信息处理器经过处理的虹膜信息的输入/输出模块。本发明的移动虹膜识别系统及采用这种系统的虹膜识别方法在移动设备中增加了简单的虹膜识别系统硬件，从而可以使用户更方便地进行虹膜识别操作。