一种使用于设置在多个扇区的快闪存储单元阵列的擦除方法，其中各扇区具有一个擦除标记，而所欲擦除的扇区的擦除标记则被设定为第一值。自第一扇区至最后扇区，而各扇区第一地址至最后地址中标记设为第一值的存储单元依次被验证。当验证失败且同一存储单元验证次数小于预定数目时，施加一擦除脉冲至此扇区及再验证同一存储器地址；若验证失败且同一存储单元验证次数到达预定数目时，验证其标记设定为第一值的剩余扇区。当欲擦除的扇区中各存储单元通过验证时，将此扇区的擦除标记设为第二值，当欲擦除的各扇区的标记设为第二值时，终止擦除操作。