本发明公开了一种退货处理方法及其系统，应用在物流中心的退货处理上，物流中心至少包含一退货包件收取登录区、一退货包件拆包刷退区及一退货品项暂存上架区，其主要是在退货包件收取登录阶段增加对退货包件的控管信息，然后在退货包件拆包刷退阶段建立实际退货品项、台车格位与上架储位之间的关联管理，并在退货品项暂存上架阶段进一步结合电子卷标机制来迅速引导完成台车上所有退货品项的上架暂存操作，使物流中心达到减少人力时间及提升退货效率的目的。