本发明公开了一种超临界提取与喷雾干燥耦合制备花椒油微胶囊的方法，包括如下步骤：(1)将花椒置于萃取器中在CO₂的超临界条件下，进行萃取，(2)将萃取器出口的萃取物与乳化液送至设置在喷雾干燥塔顶部的同轴喷嘴，在同轴喷嘴的出口，萃取物中的花椒油与乳化液乳化，然后喷淋而下，雾喷干燥，获得花椒油微胶囊。本发明操作简便，制备时间短，实现热敏感物质从提取到微胶囊制备一步完成，所获得的产品宜直接食用或贮藏，极大的防止了花椒油中间处理的氧化、变质问题。花椒油的直接包埋率可达到55％以上，未得到包覆的花椒油可以回收得用，减少天然植物挥发油的损失。