本发明涉及制备新型免疫奶粉的方法，为解决全球尚无可完全代替母乳的奶粉以及普通奶粉不含免疫抗体之问题，本发明方法中，分析母乳抗体构成选择相对应的病原体并研究确定最常见的感染性疾病之病原体。分别培养这些病原体，或者应用基因工程制备表达蛋白，再用特殊方法制备相应的复合抗原；然后，用这些抗原免疫产蛋禽类，对于婴儿奶粉则制备跟母乳所含的抗体种类相一致的复合IgY，对于普通免疫奶粉则制备抗相应病原体的特异性IgY或根据不同功效要求组合成各种复合IgY。取所得的IgY加入卵磷脂，再通过特殊的干粉混合法或液态混合法与奶粉或奶水按适当比例进行混合(后者需喷雾干燥)，即可制成可代替母乳的婴儿免疫奶粉或具防治疾病功效的免疫奶粉。