本发明说明了一种质谱系统。该质谱系统包括用于电离样品流的离子源、位于离子源下游用于获取样品流的质谱数据的检测器、以及连接到检测器的数据分析仪。数据分析仪包括处理质谱数据以得到色谱图的色谱图发生器、将选择判据应用于色谱图以从色谱图选择数据点的数据点选择器、以及将鉴别判据应用于数据点以检测色谱图中的峰的峰鉴别器，其中峰指示样品流中被分析物的存在。本发明还说明了用于质谱系统的一种计算机可读介质以及处理质谱数据的一种方法。