本发明涉及一种微波炼制中药的系统，包括微波发生器、微波萃取蒸发浓缩器、浸膏干燥脱水机、粉碎机、震动筛和药粉包装机，其中，所述微波萃取蒸发浓缩器由微波换能器和萃取蒸发室构成。微波换能器包括微波可穿透的材料制成的中央管、微波不能穿透的材料制成的外夹套管以及上、下端盖。萃取蒸发室用分隔板分隔成多个分隔室，它们与萃取蒸发室内的中央分配盘之间的物料流通关系通过相对应的下通阀来控制。微波换能器与萃取蒸发室通过上、下循环管构成回路。上循环管从微波换能器出口延伸进入萃取蒸发室中央与所述中央分配盘连接，下循环管配备有强制循环泵。本发明系统用微波能源取代传统之明火、直接电热和蒸汽锅炉热源，革除了与上三种热源衍生的传热面所引生的垢病。