一种多载波通信中基于CAZAC序列的小区搜索结构及其搜索方法，所述小区搜索结构中，相邻三个小区邻接的三个扇区中至少有两个扇区在频域上互相正交。所述小区搜索方法，包括以下步骤：取三个不同扇区的子载波簇；对中各子载波序列进行差分计算；检测差分计算后的结果。本发明采用不同的扇区使用不同的子载波簇的技术方案。尤其是在三个邻近小区的中心，此方案的性能超越了三个扇区分配相同的子载波簇的方法。不但有效的增强了多小区环境下的小区搜索能力，而且在原有摩托罗拉方案的基础上又可进一步的降低了实现复杂度。