本发明属于中药制药技术领域，具体公开了一种莪术油毫微囊滴眼液制剂及其制备方法，其特征在于它是莪术油与聚氰基丙烯酸正己酯制成毫微囊，毫微囊与增溶剂、渗透压调节剂、抗氧剂、增粘剂、防腐剂制备而成；本发明还公开了上述滴眼液制剂的制备方法。该滴眼液制剂具有很好的抗菌、抗病毒、抗炎作用，与此同时提高了药物在结膜和角膜中的吸附时间，使疗效得到显著提高，使药物具有更明显的靶向作用。药理实验表明，本发明的滴眼液能很好的治疗眼科方面的疾病。