一种对流式微波干燥灭菌设备，属于医药、食品、造纸等领域的干燥灭菌设备，具体涉及一种微波干燥灭菌设备的加热箱及炉门结构。该对流式微波干燥灭菌设备包括加热箱箱体、加热箱炉门、微波发生器、传输带及抽湿系统，其特征在于：在所述加热箱炉门、加热箱箱体上单独或同时设有与抽湿系统形成空气对流的对流孔。由于单独或同时在加热箱炉门、加热箱箱体上增设了对流孔，使得物料在干燥灭菌的过程中，加热箱内形成对流的空气，对物料进行均匀抽湿及干燥，有效防止了物料因湿度过大造成的变形，且避免了不必要微波能的损耗，提高了生产效率。