本实用新型属于纳米技术及生物学技术应用领域，提供了一种治理船舶压载水生物入侵的装置，包括：压载水进口、阀、初滤装置、泵、压力表、微孔陶瓷过滤器、压力表、紫外辐射装置、阀和压载水出口，微孔陶瓷过滤器由过滤器进水口及设在其上的在壁流式微孔通道和过滤器出水口构成，微孔陶瓷过滤器为微米或纳米结构并采用直流或壁流方式，本实用新型的有益效果是所用装置体积小，耗能少，设备投入和运行费用低，维护方便。采用纯物理的方法，不破坏水质的物理和化学特性，对生态环境的负面影响极小。