激光诱导荧光共聚焦扫描装置属于生物芯片检测技术领域。现有装置荧光的收集和利用效率不高，同时扫描过程中的调焦控制非常困难。本发明采用中间打孔的全反射镜对入射的激光和诱导反射的荧光进行分光，激光束经过孔径时，能量损失小，几乎全部激光能量可以照射到生物芯片上，并且在收集荧光时，荧光收集角度大，不但提高激光入射效率而且提高了荧光的收集效率。利用计算机控制，使光源的针孔和探测器的针孔保持近似共聚焦关系，只需要扫描前调焦一次，调焦控制简单方便。