本实用新型涉及一种智能水处理系统电子控制器，包括中央处理器、负离子发生器驱动电路、水循环系统驱动电路、人机界面电路、电源电路，中央处理器输出负离子控制信号给负离子发生器驱动电路，负离子发生器驱动电路根据负离子控制信号驱动负离子发生器工作，中央处理器输出水循环控制信号给水循环系统驱动电路，水循环系统驱动电路根据水循环控制信号控制水循环系统的工作，人机界面电路与中央处理器连接，将信息从用户端传送给 央处理器，或将中央处理器的信息传送给用户，电源电路整个智能水处理系统供电。本实用新型可以实现对整个智能水处理系统的控制、监测及信息显示的功能，具备智能化、可靠性高，使用及控制方便的特点。