本实用新型采用的技术方案是提供一种结石红外光谱自动分析系统，该系统包括有光源、干涉仪、样品室、接口、计算机、输出设备，由所述光源发出的红外光束进入干涉仪，经干涉仪调制后得到的干涉光打到样品上，通过样品获得含有光谱信息的干涉光打到样品室将干涉光信号变为干涉图电信号的探测器上，通过接口传输给计算机，由计算机中的数/模转换及傅里叶变换的计算，将得出的信号分别输出到输出设备。本实用新型达到的效果：本系统采用红外光谱法作为检测手段，其检测原理是依据结石样品在红外光区吸收峰的特征来确定化合物的结构和成份，为医务工作者准确分析结石的成份，了解和分析形成结石的相关因素，为预防结石复发提供科学依据。