本实用新型涉及一种移动存储设备电源控制装置及其移动存储设备，电源控制装置包括主控制器以及与其通用输入/输出端口连接的电源控制执行单元，主控制器周期检测帧起始信号，设置通用输入/输出端口，进而控制电源控制执行单元的导通或关断；本实用新型还公开了一种带有上述装置的移动存储设备。在计算机关机时或者在操作系统中执行“安全删除硬件”时，USB接口仍保持供电且移动存储设备仍保持上电。实施本实用新型，主控制器周期检测帧起始信号，设置通用输入/输出端口，通过增加一个电源控制执行单元，对移动存储设备的电源进行控制，就可以确保移动存储设备在以上两种情况时正常断电，防止移动存储设备的损坏。