本实用新型涉及一种装置，尤其是一种高通量基因检测与分型的多孔微孔板装置；该实用新型的装置由多孔微孔板与嵌在微孔内的基因芯片组成，多孔微孔板可以是各种孔型，不同孔数的微孔板，包括圆形，方形或其他孔型的12孔，24孔，48孔，96孔，384孔等，嵌在微孔内的基因芯片可以是以尼龙膜，硅片，玻璃片或塑胶片为基质，含有针对基因分型的特异性探针阵列；本实用新型革新了传统基因检测的单一手段，充分结合了基因芯片一次能同时检测一份样品中多个基因的优点和利用多孔微孔板一次能对多份样品进行检测的优点，将基因芯片嵌在多孔微孔板内构造成高通量检测装置，具有操作简单，省时省力省试剂，减少交叉污染，检测精确，结果判断直观等优点。