本发明实施例提供一种电子病历的处理方法及系统，属于电子病历技术领域，解决了现有技术中医生查看病历时需要耗费大量时间的问题。所述方法包括：根据预设病历类型、子主题分类模型和指定电子病历文本，确定指定电子病历文本中的每个电子病历文本对应的病历类型和子主题内容块；根据术语词典，parser分析器，抽取规则模板，以及病历类型和子主题内容块，得到每个电子病历文本对应的结构化信息；根据病历类型对应的摘要生成规则以及每个电子病历文本对应的结构化信息，得到每个电子病历文本对应的病程摘要；按照时间顺序，根据每个电子病历文本对应的病程摘要，得到指定电子病历文本对应的病程摘要序列。本发明实施例适用于对电子病历的处理过程。