基于语音识别的电子病历自动生成方法及系统，预先对医生进行语音录制，将录制的语音进行声纹注册；对医生和患者的语音交流信息进行实时采集，将采集的语音交流信息进行上传；对上传的语音交流信息逐句进行声纹识别，识别出语音为医生语音或患者语音，并对于识别的语音数据打上身份标签；将进行声纹识别后的语音交流信息转换为文本结果，将文本结果和对应的语音数据保存到数据库；对文本结果进行语义处理，抽取指定的数据对象元素，根据数据对象元素组织文本生成电子病历。本发明改变了当前病历书写边沟通、边整理、边记录的方式，实现病历书写自动化，使医生专注就诊过程和疾病诊断，提高就医效率，节约人力资源成本，方便后续病历查询和审核。